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二氧化碳响应曲线和光响应曲线模型分析软件资源汇总

来源:力高泰 发布时间:2017-09-12 10:56:32 点击数: 使用提问咨询价格

二氧化碳响应曲线和光响应曲线

又到了收获的季节,相信您手上已经有了一堆光合数据等待分析。这不,我们技术部最近也总是接到LI-6400XTLI-6800光合仪的用户来电,询问怎么通过软件去分析数据。关于这个问题,很多文献都有提及。在一些方法中,只需用到气体交换(Gas Exchange)的数据,而一些还需要联合使用叶绿素荧光的测量参数。下面,小编就二氧化碳响应曲线和光响应曲线和模型拟合软件资源做了一个汇总。
 
二氧化碳响应曲线FvCB模型(Farquhar, von Caemmerer & Berry 1980)拟合
1 EXCEL软件(Sharkey,2015)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pce.12641/full
2 SAS软件(Dubois et al., 2007)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1469-8137.2007.02182.x/full
3基于网络的“双重优化”方法(Gu et al., 2010)
http://leafweb.ornl.gov
 
结合使用气体交换和叶绿素荧光数据
1 EXCEL(Bellasio et al., 2015)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pce.12560/full
2 EXCEL(Mouleau-Ngangue et al., 2017)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.14260/full
3 其他资源
1. Excel spreadsheet –http://www.life.illinois.edu/bernacchi/links.html
2. Excel spreadsheet http://landflux.org/Tools.php
3. R code –https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols

光响应曲线拟合模型
1 Excel(Lobo et al., 2013)
http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11099-013-0045-y
其他软件资源
1 R  https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
2 EXCEL http://landflux.org/Tools.php
 
参考文献:
Farquhar G.D., Von Caemmerer S. & Berry J.A. (1980) A biochemical model of photosynthetic CO2 assimilation in leaves of C3 species. Planta 149, 78–90.