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作者简介 祝介东，毕业于中国科学院植物研究所，现为北京力高泰科技有限公司技术支持工程师。其个人微信公众号是“生态学数据分析之R和Python”。 |
用R分析LI-6400及LI-6800的数据，起源于我最初入职时LI-6400的学习笔记，其中一些构思和代码的实现是出差时晚上写的。初稿完成之后，技术部同事进行了测试并提供了反馈意见。为了更好的完善这些内容，我今年9月份将全部源码上传到了GitHub【1】。目前有两个Followers，但尚未贡献Requests，希望有志同道合的小伙伴们一起来完善这本书。
书里面的内容我经常修改，提交GitHub更新及时，方便大家及时看到更新。
《R语言分析LI-6400和LI-6800光合仪的数据》首页
对于这种查看书籍的方式，我简单介绍一下。网页上方从左到右的标记分别是 “折叠展开目录”，“搜索当前页面”，“字体字号更改”，“在线修改提交”，“pdf下载”（如下图）。
大家如果有意见和建议，可以通过“在线修改提交”功能来实现，也可以从项目主页来提交 ，网址如下
https://github.com/zhujiedong/photoanalysis
或者发送到我邮箱
zhujiedong@ecotek.com.cn
这样每次修改后的内容我都会Push到GitHub，一般几分钟后在线网页就会自动更新内容，pdf也会实时更新。
目前，《R语言分析LI-6400和LI-6800光合仪的数据》有十一章，分别是
第.一章 R 软件与Rstudio
第二章 批量处理光合测定数据
第三章 CO2 响应曲线的拟合
第四章 气孔导度模型的拟合
第五章 光合最.优气孔导度耦合模型
第六章 光合气孔导度耦合模型
第七章 RHtoVPD 函数
第八章 光响应曲线的拟合
第九章 关于非线性拟合的初始值
第十章 LI-6800 的数据分析
第十一章 环境与配置
本书可点此链接进行访问。
无法登陆GitHub的老师同学，可以点此链接。
衷心希望大家在分析光合仪数据时，这些内容能有些许帮助，同时也希望收到大家的意见和反馈，让我们一起来把其中的内容做得更完善！谢谢大家。
注：【1】GitHub是通过Git进行版本控制的软件源代码托管服务，由GitHub公司（曾称Logical Awesome）的开发者Chris Wanstrath、PJ Hyett和Tom Preston-Werner使用Ruby on Rails编写而成。截止到2015年，GitHub已经有超过两千八百万注册用户和7900万代码库。事实上已经成为了世界上最.大的代码存放网站和开源社区（源/维基百科）。